很多专家学者一致宣导：消毒大于治疗，正确的消毒胜过预防性的用药，消毒可以减少用药，用药是在消毒不能达到效果的时候的无奈之举。尽管大家都在讲疾病预防很重要，然而在防控传染性疾病工作中完全能发挥消灭传播途径的工作—消毒却做得很差。
笔者接触的所在区域养殖场户，对消毒的重视程度和免疫、药物保健、疾病治疗等相比，简直不成比例，甚至有的可以忽略不计，因为很多养殖场户不要说消毒，即使正确及时的清除粪便都是很难做到，究其原因才能发现问题，才能帮助他们建立对消毒的重视程度。
1 忽视消毒的原因
1.1 看不到直接的效果，由于消毒是一项循序渐进且将病原微生物抑制或在萌芽期进行消灭的工作，除了用于肠道病和皮肤病以外很多时候起不到特别明显的效果。
1.2 很多养殖场户认为圈舍不消毒畜禽也不生病，有时消毒了畜禽反倒生病了。
2 生产过程中消毒误区
针对以上导致养殖场户忽视消毒的原因，笔者认为正确的消毒制度和规范的消毒程序是整体性防控动物疾病，特别是重大动物疫病的重要措施之一，规范化的养殖场必须建立并严格遵循消毒制度，而很多养殖场户却把消毒制度和规范当成一句空话。首先需要我们认识到消毒工作中我们存在的误区。
2.1 消毒设备布置不规范。很多养殖场在进入的场区大门并没有设置专供进出车辆消毒的消毒池，而是只在养殖区入口处布局比较小的消毒池，更衣消毒室设置在场区门口，每栋畜舍门口没有设置供进出人员使用的消毒池或脚踏的消毒垫。
2.2 消毒设备不足。很多养殖场仅仅在消毒室四角或天花板上设置对衣服皱褶内的病原微生物没有杀灭作用的紫外线灯，而没有完善的喷雾设备，场门口没有冲洗设备。
2.3 消毒设备无法做到合理利用。厂区入口专供进出车辆使用的消毒池不能发挥作用，有的过浅或过短，有的渗水，有的长期不放置或长期不更换消毒药物，消毒设备形同虚设。
2.4 生产厂区的圈舍工艺流程不规范。很多养殖场不存在空舍期（特别是养猪场），导致没有办法对圈舍进行彻底而全面的消毒，这也是很多养殖场饲养环节中疾病多发的一个原因。
2.5 消毒方法不准确。对消毒药物消毒前圈舍墙壁、地面等处粪污的清扫环节不重视。被消毒的现场存在粪便、饲料残渣、污水等，阻挡消毒药物有效成分的渗入。消毒药物被大量的有机物所消耗，大大降低了消毒药物有效成分对病毒、细菌、支原体等作用。有的在养殖场内部或者圈舍地面上简单的撒布一层生石灰，其实仅仅生石灰是基本起不到应有的消毒作用的。因为生石灰是氧化钙，只有遇水后生成带有氢氧根离子的熟石灰才具有消毒功能。有的养殖场户使用存放时间较长的熟石灰，但它已吸收了空气中的二氧化碳，成为没有氢氧根离子的碳酸钙，基本起不到任何的消毒功能了。
2.6 消毒药物选用不当。有的养殖场户在认定一种或两种效果较好的消毒药物后，不再定期更换，而是长期使用，导致部分病原微生物对某种消毒药物产生一定的耐药性，进而大打影响消毒作用；有的缺乏科学的消毒指导，仍然单纯使用季铵盐类、酚类、乙醇等对某些病毒或特定环境消毒效果很差的消毒剂；有的养殖场户配制消毒药液时，随意更改配比浓度，甚至认为气味或刺激性越重的消毒药效果越好，且无限度的加大消毒药的用量，强烈的刺激性气味更加加重畜禽呼吸系统疾病的发生和发展。有的消毒液配好后一部分没有用完，剩余的在过长时间存放后继续使用，甚至两种药物混合或同时在同一地点使用，这些种种不正确的消毒药物的配制与使用方法，极大的降低着消毒药物的作用，甚至根本达不到任何消毒作用。
3 常用的消毒药物种类及如何合理选择和使用
3.1 常用消毒剂种类。常用消毒剂有酸类、碱类，酚类，醇类，醛类，卤素类，重金属盐类，表面活性剂等。
3.2 合理选择消毒剂。临床宜选择抗菌谱广、杀菌力强、作用迅速、消毒持续时间长、作用效果受温度和湿度等影响较小、对畜禽刺激性和养殖设备腐蚀性较小、对人畜安全、廉价易得的消毒剂品种。
3.3 正确使用消毒剂。用于畜禽厩舍、粪池、污染场地、水源屠宰场等以及运输工具、器械消毒等消毒的消毒剂通常可以用季铵盐类、酚类消毒剂、醛类消毒剂、卤素类消毒剂。用于皮肤表面消毒时可使用苯扎溴铵、乙醇、碘酊、聚维酮碘、过氧化氢溶液等。无论选用何种用途的消毒剂，使用前都应该认真阅读产品使用说明书。
3.4 使用消毒劑应注意事项。结合自身情况制定消毒方案；准备好消毒器具及所需物品；被消毒表面需预先刷洗干净，按产品标签配制（稀释）消毒液；保证足够的消毒时间；建立交替轮换使用消毒剂；工作人员在消毒时应穿防护服与戴防护眼镜、口罩、手套等，如不慎沾到皮肤时，应立即用水冲洗；避免小孩接触；消毒过程中产生的废水及消毒剂废弃包装，应集中无害化处理，不要污染环境与水源。
3.5 正确进行畜禽饮水消毒。目前，经批准使用在畜禽饮水消毒的消毒剂，有二氯异氰脲酸钠粉、聚维酮碘、碘酸混合液、癸甲溴铵溶液等，在使用过程中要严格按照产品说明书中给出的方法和用量对畜禽饮水进行消毒。